凝膠電泳常見問題分析

要跑瓊脂糖凝膠電泳， 5ng 就能很清楚的跑出來是這樣嗎？能夠照相的清楚的條帶，至少需要多少量呢？
參考見解：5ng 已經可以了，但是或許20ng50ng-200ng效果好，在此范圍內呈線性。

把210bp的pcr產物進行酶切,得到190+20bp的兩個片段,請問能用瓊脂糖凝膠電泳檢測酶切結果嗎?用多大濃度的膠和多大的電壓呢?
參考見解：可以用瓊脂糖凝膠電泳分開,電壓不變,可用1.5%到2%的膠,20bp得片斷不一定能看得到,所以應用未酶切的PCR片斷作對照.

丙烯酰胺凝膠電泳更適合于分離純化小分子量核酸（5-500bp）并且分辨率高，可以達到1個bp。所以建議進行丙烯酰胺凝膠電泳試試。

Marker做瓊脂糖凝膠電泳，發現Marker在加樣孔有一個明顯的亮帶，什么原因？
參考見解：marker有時會出現這樣的問題,應該是時間久了。新買時跑膠在點樣孔沒有,過一段時間就會在點樣孔出現亮點。也可能是蛋白，有時DNA提的不純含有蛋白時就會出現上樣孔有條帶的現象。

瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA時,跑出的帶后面出現拖尾現象,什么原因造成的?
參考見解： DNA帶模糊??：
1、 DNA降解??避免核酸酶污染。
2、 DNA上樣量過多??減少凝膠中DNA上樣量。
3、 所用電泳條件不合適??電泳時電壓不應超過20V/cm，溫度＜30℃,巨大DNA鏈，溫度應＜15℃，核查所用電泳緩沖液是否有足夠的緩沖能力。
4、 DNA樣含鹽過高??電泳前通過乙醇沉淀去除過多的鹽。
5、 有蛋白污染??電泳前酚抽提去除蛋白。
6、 DNA變性，?電泳前勿加熱，用20mM NaCl緩沖液稀釋DNA。

將從組織提取的DNA進瓊行脂糖凝膠電泳，用的1.5%的膠加了EB，80V跑1小時，溴酚藍已經跑到頭了，在紫外燈觀察什么帶也沒有，只見孔里面有橘紅色的亮光。好象沒跑出來，是怎么回事？

參考見解：
1、 根據目的條帶長度來調整凝膠濃度，一般1.5％左右，也不一定。
2、 紫外燈下沒見帶，不一定沒有出孔，而是量少看不到，可以測一下濃度看一下，或直接試跑一下PCR。
3、 加一個marker孔，尤其你*次跑膠時。
4、 電泳時間可能過長，一般75v×30min左右，但是具體看溴酚藍的離孔距離和目的條帶離孔距離。